Les risques principaux qu’entraîne pour les oiseaux l’utilisation de l’énergie éolienne sont de deux natures : la détérioration de leur habitat, et la collision avec les rotors et les mâts des installations. D’une manière générale, la loi prévoit que les installations et les constructions à même de polluer ou de perturber gravement l’environnement doivent être soumises à une étude d’impact (EIE – étude de l’impact sur l’environnement). Une EIE est obligatoire pour les projets éoliens dont la puissance est égale ou supérieure à 3 mégawatts. A ce jour, il n’existe pas de prescriptions officielles au niveau national sur les exigences d’une EIE dans le domaine de l’énergie éolienne, avec pour conséquence une qualité très variable de ces études selon les cantons. Pour pallier ce problème, la Station ornithologique suisse a élaboré un guide, dans lequel elle recommande des standards méthodologiques pour ces investigations concernant l’avifaune. D’un point de vue de la protection des oiseaux, les installations éoliennes doivent être érigées de préférence dans des zones présentant un risque de conflit le plus faible possible.
Conflits oiseaux – homme